Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms