Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BACE1P56817 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BACE1P56817 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms