Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms