Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IDH3AP50213 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms