Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms