Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms