Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXN2P32314 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms