Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms