Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms