Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms