Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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