Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDC1P18827 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SDC1P18827 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDC1P18827 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDC1P18827 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms