Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NME1P15531 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms