Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD2P13995 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms