Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms