Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DMDP11532 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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