Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHGAP10645 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms