Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms