Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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