Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms