Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSL4O60488 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms