Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDE6DO43924 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PDE6DO43924 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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