Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNJ1O43426 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNJ1O43426 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms