Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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