Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms