Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms