Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms