Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRRM4A7MD48 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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