Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEU3Q9UQ49 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms