Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI4Q9UM07 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms