Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB23Q9ULC3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB23Q9ULC3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB23Q9ULC3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB23Q9ULC3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RAB23Q9ULC3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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