Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms