Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP2Q9P2J9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms