Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf42Q9NWW7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms