Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms