Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms