Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRDM12Q9H4Q4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms