Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms