Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms