Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms