Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms