Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms