Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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