Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms