Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1LQ96C74 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms