Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3KBP1Q96B97 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms