Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC9Q92623 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTC9Q92623 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms