Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms