Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BEST4Q8NFU0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BEST4Q8NFU0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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