Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms